系统发生网络的空间

计算生物学中的一个经典问题是给定 n 个物种间的一组距离来构建系统发生树。在多数情况下，树结构过于受限。我们考虑一种环状分裂网络，它是树的一种推广，其中多条平行边表示分化。引入了此类网络的几何空间，构成了 Billera, Holmes 和 Vogtmann 关于树空间工作的自然扩展。我们探索了该空间的性质，并展示了实曲线模空间紧致化在该空间内的自然嵌入。