欧几里得空间中距离数据分布的建模
种群与进化
2016-06-21 v1
摘要
系统发育推断——即推导一组物种共同演化历史的假设——是生物学、计算机科学、数学和统计学交叉领域的一个活跃研究方向。人们假设数据中包含系统发育信号，由于所用方法的质量和数据本身的质量，该信号将以不同的精度被恢复。基于距离的推断方法的输入是欧几里得空间的一个元素，其坐标以生物体对为索引。对于若干算法，存在将该空间划分为多面体锥的细分，使得同一锥内的输入返回相同的树拓扑。这些锥的几何性质已被用于分析推断算法。在本章中，我们对源自 DNA 序列的输入数据点在整个欧几里得空间中相对于树度量空间的分布进行建模，而该树度量空间同样可以描述为多面体锥的集合。
引用
@article{arxiv.1606.06146,
title = {Modeling the distribution of distance data in Euclidean space},
author = {Ruth Davidson and Joseph Rusinko and Zoe Vernon and Jing Xi},
journal= {arXiv preprint arXiv:1606.06146},
year = {2016}
}
备注
To appear in the AMS Contemporary Mathematics Series