一种基于回归的简单方法用于定位函数值表型背后的数量性状位点
应用统计
2014-08-11 v2
摘要
大多数数量性状位点（QTL）定位统计方法专注于单一表型。然而，通常会测量多个表型，且近期的技术进步极大地简化了大量表型（包括随时间测量的生长等函数值表型）的自动化获取。虽然存在针对函数值表型的 QTL 定位方法，但它们通常计算量大且专注于单 QTL 模型。我们提出了两种简单、快速的方法，在保持高统计功效和精度的同时，适用于利用惩罚似然法扩展至多 QTL 模型。通过这些方法识别出多个 QTL 后，我们可以观察函数值 QTL 效应，以更深入地理解 underlying 过程。我们的方法已实现为 R 语言包 funqtl。
引用
@article{arxiv.1403.3048,
title = {A simple regression-based method to map quantitative trait loci underlying function-valued phenotypes},
author = {Il-Youp Kwak and Candace R. Moore and Edgar P. Spalding and Karl W. Broman},
journal= {arXiv preprint arXiv:1403.3048},
year = {2014}
}
备注
Considerable changes in response to reviewers' comments. Revised the initial simulation study. Moved one figure to supplement; added another figure plus three additional supplemental figures