多个动态性状的功能定位
统计方法学
2016-05-24 v1
摘要
许多生物现象在时间和空间上经历发育变化。功能定位旨在定位影响发育模式的基因，是研究生物变化的遗传架构的重要工具。通常生物过程由发育和生理组分的网络介导，因此更好地由多表型描述。在本文中，我们开发了一个用于功能定位的多元模型，该模型能检测和表征同时控制多个动态性状的数量性状位点（QTLs）。由于 QTLs 的真实基因型未知，多个动态性状的测量使用混合分布建模。多个动态性状的函数均值使用非参数回归方法估计，从而避免了对函数均值的任何参数假设。我们提出剖面似然方法来估计混合模型。利用似然比检验来检验对不同的但发育相关性状存在多效性效应。实施了一项模拟研究以说明我们所提方法的有限样本性能。我们还通过识别同时控制大豆三个动态性状的 QTLs 来演示我们的方法。这三个动态性状是整个大豆的叶、茎和根的时间进程生物量。遗传连锁图由 950 个微卫星标记构建。新模型有助于我们理解复杂动态性状随时间的遗传控制机制。
引用
@article{arxiv.1605.06837,
title = {Functional Mapping of Multiple Dynamic Traits},
author = {Jiguo Cao and Liangliang Wang and Zhongwen Huang and Junyi Gai and Rongling Wu},
journal= {arXiv preprint arXiv:1605.06837},
year = {2016}
}