基因网络中调控基因与eQTLs的检测
分子网络
2016-11-02 v2 基因组学
摘要
与数量表型性状（包括疾病状态）相关的个体间遗传差异通常位于非编码基因组区域。这些遗传变异也常与被邻近基因表达水平差异相关（它们被称为“表达数量性状位点”即eQTLs），并可能发挥基因调控作用，影响相互作用基因、蛋白质和代谢物的分子网络状态。因此，从大规模组学数据重建因果基因网络的计算系统生物学方法，对于理解受eQTLs及其他调控基因控制的网络结构，以及生成从基因型到表型的分子机制的详细假设至关重要。本文综述了识别eQTLs及其关联基因、重建共表达网络与模块、重建因果贝叶斯基因与模块网络，以及在计算机中验证预测网络的主要分析方法和软件。
引用
@article{arxiv.1512.05574,
title = {Detection of regulator genes and eQTLs in gene networks},
author = {Lingfei Wang and Tom Michoel},
journal= {arXiv preprint arXiv:1512.05574},
year = {2016}
}
备注
minor revision with typos corrected; review article; 24 pages, 2 figures