信号网络的最小模型阐明细胞凋亡中的细胞间随机变异性
分子网络
2010-09-14 v1 生物物理
摘要
信号网络旨在感知环境刺激并对其进行适应。我们提出并研究了一个信号网络的最小模型,该模型能够以自适应方式感知和响应不同强度的外部刺激。该最小网络的结构是基于其对外部刺激的差异性响应的一些简单假设推导得出的。我们采用随机微分方程和从随机模拟中获得的概率分布来表征我们最小网络模型中的差异性信号响应。我们表明,所提出的最小信号网络在刺激强度降低时表现出两种截然不同的响应类型。该信号网络有一个确定性部分,在强刺激下会快速激活,此时细胞间的波动可以忽略。随着刺激强度降低,网络的随机部分开始主导信号响应,观察到缓慢激活,并伴有特征性的大细胞间随机变异性。有趣的是,这个提出的随机信号网络能够捕捉到通过实验和大规模计算机模拟研究过的复杂凋亡细胞死亡信号网络的一些基本信号行为。因此,我们声称所提出的信号网络是凋亡信号传导的一个合适的最小模型。阐明复杂细胞信号通路(如凋亡信号传导)的基本设计原理仍然是一项具有挑战性的任务。我们展示了我们的最小模型如何帮助阐明特定凋亡抑制剂Bcl-2对凋亡信号传导的细胞类型非依赖性影响。我们还讨论了我们的研究在阐明细胞死亡信号通路的适应策略方面的意义。
引用
@article{arxiv.1009.2294,
title = {A Minimal Model of Signaling Network Elucidates Cell-to-Cell Stochastic Variability in Apoptosis},
author = {Subhadip Raychaudhuri},
journal= {arXiv preprint arXiv:1009.2294},
year = {2010}
}
备注
9 pages, 6 figures