细胞分化网络的结构要求与区分
定量方法
2011-07-06 v1
摘要
干细胞分化的数学模型通常基于后续细胞命运决定的概念，每个决定由一个基因调控网络控制。这些网络表现出多稳态行为，并导致系统在性质不同的稳定稳态之间切换。然而，这种切换模块的网络结构通常是不确定的，并且缺乏关于确切反应动力学的知识。因此，在本文中，我们对由三个负责细胞分化的相互作用的转录调控因子组成的小网络进行基础性研究：我们研究哪些网络结构可以再现特定的多稳态行为，以及每个网络实现该行为的鲁棒性如何。为了探讨这些问题，我们使用一个仅利用网络定性信息的建模框架，该框架既允许模型区分，也允许评估所需多稳态特性的鲁棒性。我们揭示了实现细胞分化所需的不同稳态模式所必需且充分的网络结构特性。我们的结果还表明，网络的结构特性和鲁棒性相互关联。
引用
@article{arxiv.1107.0900,
title = {Structural requirements and discrimination of cell differentiation networks},
author = {Christian Breindl and Daniella Schittler and Steffen Waldherr and Frank Allgöwer},
journal= {arXiv preprint arXiv:1107.0900},
year = {2011}
}
备注
14 pages, 4 figures, will be presented at the IFAC world congress 2011