生物调控网络具有最小阻挫
分子网络
2020-08-26 v1
摘要
刻画生物网络与随机网络之间的差异，可以揭示使细胞类型建立等关键生物学功能得以稳健实现的设计原理。然而，以往聚焦于识别生物网络中特有而随机网络中缺失的拓扑特征的研究，很少提供功能层面的见解。我们使用布尔建模框架以及自旋玻璃文献中的思想，来识别五个真实生物网络与具有相似拓扑特征的随机网络之间的功能差异。我们表明，最小阻挫是一种基本属性，它使生物网络能够稳健地建立细胞类型并调控细胞命运选择，并且这一属性可以通过达尔文进化在复杂网络中涌现。该研究还提供了关于在诸如癌症等疾病中细胞命运选择调控如何出错并导致异常细胞类型涌现的线索。
引用
@article{arxiv.1911.10252,
title = {Biological Regulatory Networks are Minimally Frustrated},
author = {Shubham Tripathi and David A. Kessler and Herbert Levine},
journal= {arXiv preprint arXiv:1911.10252},
year = {2020}
}
备注
5 pages, 4 figures