从细胞对多重线索的响应中检测信号机制
分子网络
2022-11-07 v2 生物物理
摘要
细胞信号网络复杂且常未被完全表征，难以获得其所编码机制的全貌。对这些网络进行数学建模可提供重要线索，但模型本身往往复杂，且如何提取可证伪的预测并不总是明确。本文采用逆向方法，利用细胞层面的实验数据推导最小信号网络。我们聚焦于细胞对多重线索的响应，特别是响应呈拮抗性的令人惊讶的情形：对多重线索的响应弱于对单个线索的响应。我们逐个节点系统地构建候选信号网络，使用普遍存在的要素：(i)上调或下调，(ii)分子转换，或(iii)可逆结合。在每种情况下，我们的方法都揭示出一个解释拮抗性响应的最小且可解释的信号机制。我们的工作提供了一种从细胞层面数据推导分子机制的系统性方法。
引用
@article{arxiv.2205.02699,
title = {Detection of signaling mechanisms from cellular responses to multiple cues},
author = {Soutick Saha and Hye-ran Moon and Bumsoo Han and Andrew Mugler},
journal= {arXiv preprint arXiv:2205.02699},
year = {2022}
}
备注
16 pages, 11 figures