遗传与代谢网络界面处负反馈环的结构与功能
分子网络
2007-05-23 v1 其他凝聚态物理
摘要
生物体内的分子网络由转录/翻译调控、蛋白质-蛋白质相互作用/修饰以及代谢网络组成,共同形成一个使细胞能明智响应其环境中存在的多种信号分子的系统。因此,这一整体分子调控系统的关键是遗传网络与代谢网络之间的界面。在此界面处频繁出现的一个基序是用于调控信号分子水平的负反馈环。本工作中我们使用数学模型研究不同负反馈环的稳态与动力学行为。我们特别表明,信号分子不引起转录因子从DNA解离的反馈环比分子通过隔离转录因子脱离DNA起作用的反馈环响应更快。我们使用大肠杆菌中的bet、mer和lac系统三个例子来说明此类反馈环的行为。
引用
@article{arxiv.q-bio/0604029,
title = {Structure and function of negative feedback loops at the interface of genetic and metabolic networks},
author = {Sandeep Krishna and Anna M. C. Andersson and Szabolcs Semsey and Kim Sneppen},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0604029},
year = {2007}
}
备注
8 pages, 4 figures