负反馈回路对布尔网络动力学的影响
定量方法
2009-11-13 v2 分子网络
摘要
动态网络中的反馈回路在决定该网络的动力学中起着重要作用。通过一项计算研究，本文表明，具有较少独立负反馈回路的网络往往比具有更多负回路的网络表现出更规则的行为。确切地说，我们研究了独立反馈回路的数量与动态布尔网络相空间中极限环的数量和长度之间的关系。我们表明，随着独立负反馈回路数量的增加，极限环的数量（长度）倾向于减少（增加）。这些结论与以下事实一致：对于某些自然生物网络，它们一方面表现出普遍的规则行为，另一方面显示出比具有相同节点数和连通性的随机网络更少的负反馈回路。
引用
@article{arxiv.0707.3468,
title = {The effect of negative feedback loops on the dynamics of Boolean networks},
author = {Eduardo Sontag and Alan Veliz-Cuba and Reinhard Laubenbacher and Abdul Salam Jarrah},
journal= {arXiv preprint arXiv:0707.3468},
year = {2009}
}