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具有动态增长域的高性能肿瘤生长元胞自动机模型

定量方法 2013-09-25 v1 细胞行为

摘要

肿瘤从单个转化癌细胞生长到临床可见的肿块,跨越了多个空间和时间的数量级。实现此类肿瘤生长的元胞自动机模拟可能很简单,但计算性能往往抵消了其简单性。通过选择适当的数据结构、内存与细胞处理以及域设置,可以实现计算上便捷的模拟时间。我们提出了一种肿瘤生长的元胞自动机模型,其域随着肿瘤群体的增加而动态扩展。我们讨论了内存访问、数据结构和实现技术,这些技术产生了高性能的多尺度 Monte Carlo 肿瘤生长模拟。我们展示了肿瘤生长模型的模拟结果,并讨论了有利于所提出高性能设计的肿瘤特性。

关键词

引用

@article{arxiv.1309.6015,
  title  = {A High-Performance Cellular Automaton Model of Tumor Growth with Dynamically Growing Domains},
  author = {Jan Poleszczuk and Heiko Enderling},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1309.6015},
  year   = {2013}
}

备注

8 pages, 8 figures