一种用于泊松-玻尔兹曼溶剂化模型的区域分解方法
数值分析
2018-12-20 v2 计算物理
摘要
本文提出了一种用于计算化学中广泛使用的泊松-玻尔兹曼（PB）溶剂化模型的区域分解方法。该方法简称为 ddLPB，利用范德华空腔作为溶质空腔，求解定义在 中的线性泊松-玻尔兹曼（LPB）方程。采用 Schwarz 区域分解方法，将空腔分解为相互重叠的球，并仅在各球中求解一组耦合的子方程来构造局部问题。给出了一系列数值实验以检验该方法的鲁棒性和效率，并与一些现有方法进行了比较。我们观察到溶剂化能量相对于自由度数量呈指数收敛，这使得该方法在与溶质的量子力学描述耦合时能够达到所需的精度水平。
引用
@article{arxiv.1807.05384,
title = {A Domain Decomposition Method for the Poisson-Boltzmann Solvation Models},
author = {Chaoyu Quan and Benjamin Stamm and Yvon Maday},
journal= {arXiv preprint arXiv:1807.05384},
year = {2018}
}