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特定类别系统发育网络的二分律

种群与进化 2025-09-24 v3 组合数学

摘要

文献中已提出多种类别的系统发育网络。其中几个类别的一个特征是,如果将属于该类别的网络限制在其叶节点的一个子集上,所得网络可能不再属于该类别。这对其生物学适用性具有影响,因为某些物种——即底层进化网络的叶节点——可能会缺失(例如,它们可能已经灭绝,或者没有相关数据可用),或者我们可能只是希望将注意力集中在物种的一个子集上。另一方面,某些网络类别在限制于叶节点子集时是“封闭”的,例如 所有系统发育网络或所有系统发育树的类别; 疱状网络、单纯网络、疱状树的类别;以及 具有某个在叶节点子采样下单调的参数(例如,网状节点数、高度等)且被某个固定值所界定的网络类别。容易证明,系统发育树的封闭子类要么包含所有树,要么仅占其极小比例(随着叶节点数的增长)。在本文中,我们探讨这种二分律现象是否适用于其他类别的系统发育网络及其子类。

关键词

引用

@article{arxiv.2506.23223,
  title  = {A dichotomy law for certain classes of phylogenetic networks},
  author = {Michael Fuchs and Mike Steel},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2506.23223},
  year   = {2025}
}

备注

15 pages, 3 figures