离子通道中的电压传感:生物器件的介观模拟
生物大分子
2019-01-18 v4 生物物理
定量方法
摘要
电压门控离子通道的电信号传导依赖于电压传感器(VS)的功能,该传感器在电压门控 K+ 通道中由 S1-S4 结构域表征。本文中,我们使用基于 VS 电荷、线性介电质和整体运动的模拟,研究了 VS 滑动螺旋模型的某些能量学方面。采用边界元方法求解电压钳边界条件下的模型静电学。计算了静电构型能的统计力学后果,以深入了解滑动螺旋机制并预测实验测量的系综性质,如外加电压位移的门控电荷。针对两种交替的 S4 构型,即 \alpha 螺旋和 3(10) 螺旋,研究了这些后果和系综性质。发现两种形式的 VS 都具有固有的静电稳定性。最大电荷位移受几何形状限制,具体而言即 S4 电荷与反电荷在弱介电质区域重叠的运动范围。与 3(10) 螺旋传感器相比,\alpha 螺旋传感器的电荷位移对电压的响应更陡峭。这种差异源于静电能景观中约 0.1 eV 量级的差异。作为将这些 VS 模型整合到全通道模型中的一步,我们在系统的哈密顿量中加入了一个假想的外部负载,并分析了 VS 的能量输入/输出关系。
引用
@article{arxiv.1203.6061,
title = {Voltage sensing in ion channels: Mesoscale simulations of biological devices},
author = {Alexander Peyser and Wolfgang Nonner},
journal= {arXiv preprint arXiv:1203.6061},
year = {2019}
}
备注
arXiv admin note: substantial text overlap with arXiv:1112.2994