势能跨度作为近似自由能代理的效用

自由能计算在蛋白质折叠、对接和设计等预测任务中至关重要。然而，在这些实际应用中严格计算自由能变化成本高昂。因此最小势能被广泛用于近似自由能量。在本研究中，基于对几个天然球状蛋白质的广泛分子动力学（MD）模拟轨迹的分析，我们发现最小势能及相应最大势能项的变化与自由能变化表现出相似水平的相关性。更重要的是，我们证明势能项跨度（最大值 - 最小值）的变化——其产生可忽略的额外计算成本——与自由能变化的相关性比相应的最小和最大势能项变化显著更强。因此，势能跨度可作为另一种高效的近似自由能代理。