大型随机杂多聚物中自由能自平均化
软凝聚态物质
2009-11-07 v1 统计力学
q-bio
摘要
当前的杂多聚物理论本质上是宏观的,但应用于只有介观尺度的折叠蛋白。 在这些理论中,人们对序列进行自由能平均,以假设其具有自平均化——这一属性仅在系统具有准粘性无序且为宏观系统时才已知是成立的。通过对在简化晶格模型上进行紧凑的18、27和36聚合物状态和能量进行枚举,并对随机序列集合进行测试,我们检验了自平均化近似的有效性。我们发现序列之间自由能的波动很小,表明在真实蛋白的尺度范围内,自平均化是有效的近似。这些结果验证了某些序列设计方法,这些方法可指数加快计算设计并大大简化实验实现。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0102065,
title = {Free Energy Self-Averaging in Protein-Sized Random Heteropolymers},
author = {Jeffrey Chuang and Alexander Yu. Grosberg and Mehran Kardar},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0102065},
year = {2009}
}
备注
4 pages, 3 figures