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利用持续同调揭示神经数据中的隐藏信息

神经元与认知 2015-10-23 v1 代数拓扑

摘要

我们提出一种基于持续同调的方法,以揭示神经元活动的先验未知协变量的拓扑性质。我们的输入数据由一组感兴趣神经元的尖峰序列测量、控制神经元活动的已知刺激的候选列表、以及在整个实验过程中动物的相应状态构成。利用神经元活动的广义线性模型以及关于外部刺激效应的简单假设,我们推断并去除候选刺激对观测尖峰序列的任何贡献。持续同调随后揭示关于任何进一步的未知协变量的有用信息。

关键词

引用

@article{arxiv.1510.06629,
  title  = {Using persistent homology to reveal hidden information in neural data},
  author = {Gard Spreemann and Benjamin Dunn and Magnus Bakke Botnan and Nils A. Baas},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1510.06629},
  year   = {2015}
}