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NK 适应度景观相互作用结构的普适类

种群与进化 2018-04-04 v3

摘要

Kauffman 的 NK 模型是基因型适应度景观随机模型类的一个典范示例,旨在捕捉多基因座系统中上位相互作用的一般特征。基因型被表示为由 LL 个二元基因座组成的序列。赋予某基因型的适应度是各项贡献之和,其中每一项都是定义在由 kLk \le L 个基因座组成的子集上的随机函数。这些子集或邻域决定了该模型的遗传相互作用。尽管早期关于 NK 模型的工作表明其大多数性质对邻域的选择具有鲁棒性,但近期的研究揭示了相互作用结构对 NK 适应度景观性质具有重要且有时违背直觉的影响。本文回顾了这些进展,并提出了关于局部适应度最大值数目及选择性可达(即适应度单调)突变路径统计的新结果。具体而言,我们构建了一个统一框架来计算局部适应度最大值期望数随 LL 变化的指数增长率,并识别出两类不同的相互作用结构普适类,它们在 kk 较大时表现出该量的不同渐近行为。此外,我们证明,对于一大类我们称之为局部有界的相互作用结构,沿可达路径遍历适应度景观的概率随 LL 呈指数衰减。最后,我们利用适应性步移模型讨论了 NK 相互作用结构对演化动力学的影响。

关键词

引用

@article{arxiv.1708.06556,
  title  = {Universality classes of interaction structures for NK fitness landscapes},
  author = {Sungmin Hwang and Benjamin Schmiegelt and Luca Ferretti and Joachim Krug},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1708.06556},
  year   = {2018}
}

备注

61 pages, 9 figures