修改NK适应度景观的可达性

本文提出了两种传统NK适应度景观的修改模型，即θ NK模型和HNK模型，并通过可达性和粗糙性进行探索。θ NK模型引入参数θ，以整合亚基因型贡献中局部的Rough Mount Fuji型相关性，模拟更生物学上现实的相关适应度效应。HNK模型通过引入遮蔽机制，其中某些等位基因调节其他等位基因的表达，从而模拟基因调控网络中观察到的效应，而无需对完整网络进行建模。通过在广泛的参数范围内（N、K、θ和H）进行大量模拟，我们分析了这些修改对景观可达性和局部最优点数量的影响。我们发现，增加θ或遮蔽等位基因的数量（H）通常会提高可达性，即使在许多局部最优点存在的景观中也能实现，从而表明粗糙性不一定会阻碍进化路径。此外，不同的相互作用模式（阻塞、相邻、随机）会导致可达性和最优结构的不同观察。虽然比传统NK模型更复杂，但我们认为每个模型都提供了适应度景观的新的生物学相关方面，并为理解遗传和调控结构如何影响种群的进化潜力提供了见解。