经验适应度景观的定量分析
种群与进化
2013-01-18 v2 统计力学
摘要
适应度景观的概念是一个强有力的隐喻,它为理解进化过程的各种方面提供了洞察,并为进化研究提供了指导。直到最近,关于这些景观崎岖性的实证证据尚属匮乏,但随着构建包含有限突变组合的所有可能基因型成为可能,相关研究数量已增长到足以对景观进行分类的程度。本综述旨在识别能够有意义地比较适应度景观的上位性(epistasis)度量,并将其应用于经验景观,以辨别影响崎岖性的因素。文献中提出的各种上位性度量似乎是等价的。我们的比较表明,经验景观的崎岖性受所包含突变是有益还是有害的影响,也受涉及的是基因内还是基因间上位性的影响。最后,我们将经验景观与 Rough Mt. Fuji 模型生成的景观进行了比较。尽管该模型简单,但它极好地捕捉了实验景观的特征。
引用
@article{arxiv.1202.4378,
title = {Quantitative analyses of empirical fitness landscapes},
author = {Ivan G. Szendro and Martijn F. Schenk and Jasper Franke and Joachim Krug and J. Arjan G. M. de Visser},
journal= {arXiv preprint arXiv:1202.4378},
year = {2013}
}
备注
24 pages, 5 figures; to appear in Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment