水溶液中蛋白质瞬时扩散系数与回转半径的普适关系
统计力学
2021-03-31 v2 生物物理
计算物理
生物大分子
摘要
蛋白质构象涨落高度复杂并呈现长期关联。此处，对小蛋白质的分子动力学模拟表明，这些构象涨落直接影响蛋白质的瞬时扩散系数 。我们发现蛋白质的回转半径 呈现 涨落，且与 的涨落同步。我们的分析证明了局域斯托克斯-爱因斯坦型关系 的有效性，其中 nm 被假定为蛋白质周围的水化层。通过对具有强和弱构象涨落的不同蛋白质类型的分析，该斯托克斯-爱因斯坦型关系的有效性似乎是一种普适性质。
引用
@article{arxiv.2009.06829,
title = {Universal relation between instantaneous diffusivity and radius of gyration of proteins in aqueous solution},
author = {Eiji Yamamoto and Takuma Akimoto and Ayori Mitsutake and Ralf Metzler},
journal= {arXiv preprint arXiv:2009.06829},
year = {2021}
}