构象涨落的非马尔可夫效应对涨落扩散率朗之万方程中全局扩散系数的影响

蛋白质的局部扩散率关键取决于其构象，而构象涨落常为非马尔可夫过程。此处，我们研究具有非马尔可夫涨落扩散率的朗之万方程，其中涨落扩散率由双势阱下广义朗之万方程建模。我们发现，当广义朗之万方程中的记忆核为幂律形式时，非马尔可夫涨落扩散率会影响全局扩散率，即由长时间轨迹获得的扩散系数。另一方面，当记忆核为指数形式时，扩散系数不变。我们表明，这些非马尔可夫效应是双势阱下广义朗之万方程中初始条件对平稳分布的持久影响所致，其根源在于长期记忆。