化学反应网络随机模拟的均匀化技术
定量方法
2019-04-18 v2
摘要
本工作考虑连续时间马尔可夫链在化学反应网络背景下的均匀化方法。文献中已有工作表明，均匀化在时非齐次模型（如包含外源噪声的化学反应网络）中是有益的。本文侧重于从化学反应网络样本路径的视角理解均匀化。特别地，我们提出了一种针对时齐次模型的高效路径式随机模拟算法，其复杂度与 Gillespie 直接方法相当。因此，这一新方法扩展了均匀化方法作为计算上具吸引力之选择所适用的问题类别。此外，作为均匀化方法的新应用，我们基于分层与均匀化的结合，为化学反应网络的（原始）矩估计量提供了一种新的方差缩减方法。
引用
@article{arxiv.1811.00948,
title = {Uniformisation techniques for stochastic simulation of chemical reaction networks},
author = {Casper Beentjes and Ruth Baker},
journal= {arXiv preprint arXiv:1811.00948},
year = {2019}
}