反应扩散过程随机模拟实用指南
亚细胞过程
2007-11-19 v2 物理教育
定量方法
摘要
本文介绍了反应扩散过程随机建模的实用入门知识。不假设读者具备随机模拟的先验知识。方法通过说明性示例进行解释。文章从用于化学反应随机建模的经典 Gillespie 算法开始。然后给出了用于模拟分子扩散的随机算法。最后,介绍了基本的随机反应扩散方法。解释了随机模拟与确定性模型之间的联系,并展示了基本的数学工具(例如化学主方程)。文章最后概述了更高级的方法和问题。
引用
@article{arxiv.0704.1908,
title = {A practical guide to stochastic simulations of reaction-diffusion processes},
author = {Radek Erban and Jonathan Chapman and Philip Maini},
journal= {arXiv preprint arXiv:0704.1908},
year = {2007}
}
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35 pages