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估计离散随机化学反应网络二阶参数灵敏度的有限差分法

定量方法 2012-10-16 v2 数值分析

摘要

我们提出了一种高效的有限差分法,用于近似一类离散随机化学反应网络的期望值关于系统参数的二阶导数。该方法通过对扰动过程进行耦合,产生了比现有方法低得多的方差,从而大幅降低了求解给定问题所需的计算复杂度。此外,该方法易于实现,并将在任何使用连续时间马尔可夫链模拟动力学的场景中证明其有用性,例如种群过程。我们预期该新方法在需要海森矩阵知识的优化算法背景下将具有实用价值。

关键词

引用

@article{arxiv.1208.0843,
  title  = {A finite difference method for estimating second order parameter sensitivities of discrete stochastic chemical reaction networks},
  author = {Elizabeth Skubak Wolf and David F. Anderson},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1208.0843},
  year   = {2012}
}

备注

New format (two columns). 14 pages, 9 figures, 7 tables