ToxTrac：一款用于追踪生物的快速稳健软件
计算机视觉与模式识别
2017-06-09 v1
摘要
1. 基于视频记录的行为分析在生态学、医学、生态毒理学和毒理学等研究领域中日益流行。然而，可用于分析数据的程序，即那些免费、用户友好、通用、稳健、快速且能为不同生物（无脊椎动物、脊椎动物和哺乳动物）提供可靠统计数据的程序，却相当有限。2. 我们推出了一款用于基于图像追踪的自动化开源可执行软件（ToxTrac），该软件可同时处理在实验室环境中监测的多个生物。我们将 ToxTrac 的性能与当前网络上可获取的程序进行了比较。3. ToxTrac 的主要优势在于：i) 无需了解被追踪物体的具体几何形状；ii) 处理速度快，使用现代台式电脑，ToxTrac 处理高清视频的速率可超过每秒 25 帧；iii) 可在多个区域内同时追踪多个生物；iv) 集成了畸变校正和相机标定功能；v) 对假阳性结果具有鲁棒性；vi) 若发生交叉，可保持个体识别；vii) 以图像、文本和 Excel 格式导出实际尺度下的有用统计数据和热图。4. ToxTrac 可用于昆虫、鱼类、啮齿动物或其他物种的高速追踪，并提供有用的运动信息。我们建议在未来的动物行为研究中，无论研究领域如何，均可使用 ToxTrac。在此下载 ToxTrac：https://toxtrac.sourceforge.io
引用
@article{arxiv.1706.02577,
title = {ToxTrac: a fast and robust software for tracking organisms},
author = {Alvaro Rodriquez and Hanqing Zhang and Jonatan Klaminder and Tomas Brodin and Patrik L. Andersson and Magnus Andersson},
journal= {arXiv preprint arXiv:1706.02577},
year = {2017}
}
备注
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