通过基于策略驱动的模型重建蛋白质残基网络以实现蛋白质折叠路径
生物大分子
2026-04-07 v1 机器学习
摘要
一种利用合适节点选择和边恢复策略来重建蛋白质残基网络的方法，产生了与 52 个二态折叠文件夹和 21 个多态文件夹的已发表折叠速率高度相关的数值观察（Pearson 相关系数 < -0.83）；在折叠家族水平上也存在强相关性。这些结果是巧合地通过 ND 模型获得的，后者此前已介绍，但此处扩展了具有根据特征状态决定动作的策略。该结果指向了节点选择和随机种子对于 ND 模型中策略搜索快速成功的重要性。这两个条件——合适的策略和随机种子——（由强相关统计量所证明的）为 ND 中的蛋白质折叠建模创造了有利环境。值得注意的是，对恢复边序列的序列检视，以潜在的蛋白质折叠路径。为此，收集轨迹数据以进行分析和进一步模型评估和开发。
引用
@article{arxiv.2604.04677,
title = {Towards protein folding pathways by reconstructing protein residue networks with a policy-driven model},
author = {Susan Khor},
journal= {arXiv preprint arXiv:2604.04677},
year = {2026}
}
备注
8 pages, 5 figures, 3 tables