随机长度时间序列的时间不可逆性检验：应用于DNA的匹配时间方法

在本工作中，我们实现所谓的匹配时间估计量，用于估计符号序列的熵率与熵产生率。这些估计量基于系统的递归性质，已证明特别适用于检验具有大相关性或记忆的序列的不可逆性。基于匹配时间的极限定理，我们推导了在拥有一组有限随机时长的中等长度符号时间序列时熵率的最大似然估计量。我们表明所提出的估计量具有若干性质，使其适用于在样本序列具有不同长度（如DNA的编码序列）时估计熵率与熵产生率（或检验不可逆性）。我们在一些受控的马尔可夫链例子中检验了我们的方法。我们还将估计量应用于基因组序列，表明人类DNA编码序列的不可逆程度显著大于相应的非编码序列。