CP29 捕光复合体的含时原子尺度模拟
化学物理
2021-08-25 v1 其他凝聚态物理
摘要
作为光合作用第一步的捕光作用对地球生命至关重要。对于捕光过程中光化学过程的理论描述，谱密度是关键量。它们作为建模激发能转移动力学与光谱性质的输入函数。本文应用一种近期发展的流程来确定光系统 II minor 天线复合体 CP29 中色素的谱密度，该复合体因其在高等植物非光化学淬灭过程中的积极作用而近期受到关注。为此，采用基于密度泛函的紧束缚（DFTB）方法，在量子力学/分子力学（QM/MM）框架下对每个叶绿素色素的基态动力学进行模拟。随后，使用长程修正 DFTB 方法的含时扩展，在 QM/MM 设置下沿基态轨迹获取激发能涨落。由这些结果确定了谱密度，并针对不同力场及来自其他捕光复合体的谱密度进行比较。此外，利用系综平均波包动力学研究了 CP29 复合体中的激发能转移。
引用
@article{arxiv.2104.05034,
title = {Time-Dependent Atomistic Simulations of the CP29 Light-Harvesting Complex},
author = {Sayan Maity and Pooja Sarngadharan and Vangelis Daskalakis and Ulrich Kleinekathöfer},
journal= {arXiv preprint arXiv:2104.05034},
year = {2021}
}