细胞膜上受体-配体结合的最概然动力学
分子网络
2023-02-17 v1
摘要
我们设计了一种基于随机动力学建模来预测特定受体-配体结合行为的方法。我们考虑细胞膜上受体与配体结合的动力学，其中受体和配体进行不同运动，因此分别用带高斯噪声或非高斯噪声的随机微分方程建模。我们利用基于 Onsager-Machlup 函数的神经网络计算未结合受体扩散至细胞膜的概率 。同时，我们通过求解相关的 Fokker-Planck 方程计算胞外配体到达细胞膜的概率 。进而，我们可结合 和 预测最概然结合概率。由此，我们得出关于配体最可能与受体相遇位置的某些指示，有助于更好地理解细胞对外部刺激的响应及与其他细胞的通讯。
引用
@article{arxiv.2302.08024,
title = {The most probable dynamics of receptor-ligand binding on cell membrane},
author = {Xi Chen and Hui Wang and Jinqiao Duan},
journal= {arXiv preprint arXiv:2302.08024},
year = {2023}
}
备注
12 figures