连续时间传染动力学中离散时间方法的局限性
物理与社会
2016-11-23 v1 统计力学
概率论
摘要
传染的连续时间马尔可夫过程模型被广泛研究,尤其因为其在预测现实世界传染演变和制定控制措施方面的效用。然而,经常采用离散时间方法来分析此类模型或进行数值模拟。在这种情况下,时间被离散化为均匀步长,状态间的转移速率被转移概率取代。在本文中,我们阐明了该方法的潜在局限性。我们展示了离散化时间如何导致可准确研究的模型参数值受到限制。我们考察了文献中采用的数值模拟方案,展示了与连续时间形式体系相比,同步型更新方案会如何偏倚离散时间形式体系。基于事件的模拟(如 Gillespie 算法)被提出作为最优模拟方案,无论在复现连续时间过程还是计算速度方面。最后,我们展示了离散化时间会如何影响传染病阈值的值,即便在感染率和恢复率均较大且二者比值较小时。
引用
@article{arxiv.1603.01132,
title = {The limitations of discrete-time approaches to continuous-time contagion dynamics},
author = {Peter G. Fennell and Sergey Melnik and James P. Gleeson},
journal= {arXiv preprint arXiv:1603.01132},
year = {2016}
}
备注
9 pages, 5 figures