用于软物质模拟中精确构型采样的G-JF恒温器
计算物理
2016-08-17 v1 软凝聚态物质
统计力学
摘要
我们将用于Langevin动力学模拟的统计可靠的G-JF恒温器实现到ESPREesSo分子包中，以进行软物质系统的大规模模拟。将所实现的积分方法与分子包当前在流体双层膜模拟中使用的积分器进行了对比测试。尽管后者在采样统计中表现出随积分时间步长dt增加而增大的偏差，但前者在模拟稳定范围内的所有dt下均复现了近正确的构型统计。我们得出结论：通过对现有代码非常适度的修订，人们可以利用Langevin恒温器显著改进统计采样的性能。
引用
@article{arxiv.1602.05321,
title = {The G-JF Thermostat for Accurate Configurational Sampling in Soft-Matter Simulations},
author = {Evyatar Arad and Oded Farago and Niels Grønbech-Jensen},
journal= {arXiv preprint arXiv:1602.05321},
year = {2016}
}
备注
Six pages, seven figures. Accepted for publication in Israel Journal of Chemistry