蛋白质折叠的有限尺寸效应与两态范式
生物大分子
2020-10-27 v1 软凝聚态物质
生物物理
摘要
多肽链的线团到球状转变是球状蛋白质折叠背后的物理现象。单结构域球状蛋白质通常由约30至100个氨基酸残基组成，这一有限尺寸拓宽了线团-球状相变的转变区间。基于两态模型的严谨推导，我们将多肽链的氨基酸残基数目作为参量引入两个协同性度量的表达式中，并揭示其物理意义。我们得出结论：与变性态简并度相关的度量描述了转变中所涉及的协同单元数目；此外发现著名的条件仅是将该蛋白质归类为两态折叠体的必要条件。我们还发现简单地正比于转变区间的平方。这一事实使我们能够对线团-球状相变进行经典的尺寸标度分析。而且，这两个度量被证明描述了蛋白质折叠的不同特征。
引用
@article{arxiv.2010.13612,
title = {The finite size effects and the two-state paradigm of protein folding},
author = {Artem Badasyan and Matjaz Valant and Joze Grdadolnik and Vladimir N. Uversky},
journal= {arXiv preprint arXiv:2010.13612},
year = {2020}
}
备注
5 pages, 1 figure