波动对自发编织形成的影响
软凝聚态物质
2013-09-04 v1 统计力学
生物物理
摘要
本文扩展了最近的一项工作，该工作表明依赖于螺旋结构的力可能导致两个 DNA 分子自发编织 [R. Cortini et Al, Biophys. J. 101, 875 (2011)]。此处将 DNA 中心线围绕编织轴的弯曲涨落纳入编织理论中。我们重新计算了分子对的自由能，并将其与未纳入波动时的值进行了比较。我们发现，由于分子在编织中的受限而导致的构型熵损失相当大。这一对自由能的贡献提高了由依赖螺旋的力引起自发编织所需的吸引力大小。该理论将在后续工作中进一步发展为针对机械力作用下的超螺旋和编织的理论。
引用
@article{arxiv.1302.3482,
title = {The effect of undulations on Spontaneous Braid formation},
author = {D. J. Lee},
journal= {arXiv preprint arXiv:1302.3482},
year = {2013}
}
备注
Main Text+Supplemental material. 5 figures