RNA二级结构的5'-3'端距离
组合数学
2012-01-04 v3
摘要
最近Yoffe等人观察到，RNA分子的5'-3'端之间的平均距离非常小，且在很大程度上与序列长度无关。这一观察基于数值计算以及最大化特定熵泛函的理论论证。本文计算了任意有限n下RNA二级结构5'-3'端距离的精确分布。我们进一步计算了极限分布，并表明当n=30时，精确分布与极限分布已非常接近。我们的结果表明，随机RNA二级结构的距离显著低于随机RNA序列的最小自由能结构的距离。
引用
@article{arxiv.1104.3316,
title = {The 5'-3' distance of RNA secondary structures},
author = {Hillary S. W. Han and Christian M. Reidys},
journal= {arXiv preprint arXiv:1104.3316},
year = {2012}
}
备注
27 pages, 9 figures