周期驱动 DNA 模型中的随机共振:多重转变、标度与序列依赖性
软凝聚态物质
2023-08-22 v1 统计力学
摘要
我们通过数值研究周期力作用下模型双链 DNA 解链过程中的随机共振。我们观察到,当驱动力的频率随不同力幅、温度、链长与链异质性变化时,输出信号中的随机共振出现多重峰。多重峰表明存在多个稳定与亚稳态,对应于部分解链与解链构象的动力学状态及其间的转变。我们通过考察结合碱基对比例的时间演化来量化此类转变。我们在力幅-温度平面上获得了关于主峰共振频率与峰值处输出信号的相图。我们进一步获得了改变 DNA 长度时输出信号的优异标度行为。共振行为也受链异质性影响,因其强烈依赖于周期力施加于哪个碱基对。
引用
@article{arxiv.2308.09914,
title = {Stochastic resonance in a model of a periodically driven DNA : Multiple transitions, scaling and sequence dependence},
author = {Ramu Kumar Yadav and M. Suman Kalyan and Rajeev Kapri and Abhishek Chaudhuri},
journal= {arXiv preprint arXiv:2308.09914},
year = {2023}
}
备注
6 pages, 5 figures; Published version