微生物组中广义 Lotka-Volterra 系统的稳态约化
种群与进化
2019-03-13 v3
摘要
广义 Lotka-Volterra (gLV) 方程是理论生态学的经典模型，描述一组相互作用物种的种群动态。随着这些系统中物种数量增多，其动态变得日益复杂且难以处理。我们引入稳态约化 (SSR)，一种将多物种 gLV 系统约化为二维 (2D) 子系统的方法，各子系统均服从 gLV 动态，且其基向量为高维模型的稳态。我们将此方法应用于一个实验导出的肠道微生物组模型，以观察“健康”与“疾病”微生物状态间的转变。具体而言，我们利用 SSR 探究粪便微生物移植这一针对菌群失调的颇有前景的临床疗法如何使疾病微生物状态恢复至健康。
引用
@article{arxiv.1808.01715,
title = {Steady State Reduction of generalized Lotka-Volterra systems in the microbiome},
author = {Eric W. Jones and Jean M. Carlson},
journal= {arXiv preprint arXiv:1808.01715},
year = {2019}
}
备注
11 pages, 7 figures