使用 R 包 surveillance 进行流行病现象的时空分析
统计计算
2017-05-12 v2 计算工程、金融与科学
数据分析、统计与概率
应用统计
摘要
地理编码健康数据的可获取性以及传染病的固有时间结构，导致人们对具有流行病特征的时空数据统计模型和软件的兴趣日益增加。开源 R 包 surveillance 能够处理记录感染事件的各种聚合级别：连续空间或离散空间中带时间戳和地理参考的个体级数据（病例报告），以及按时期和区域聚合的计数数据。针对每种数据类型，surveillance 包实现了可视化、似然推断以及从最近开发的捕捉地方性和流行性动态的统计回归框架进行模拟的工具。总之，本文是一份流行病现象时空建模指南，并以麻疹和侵袭性脑膜炎球菌病的公共卫生监测数据分析为例进行了说明。
引用
@article{arxiv.1411.0416,
title = {Spatio-Temporal Analysis of Epidemic Phenomena Using the R Package surveillance},
author = {Sebastian Meyer and Leonhard Held and Michael Höhle},
journal= {arXiv preprint arXiv:1411.0416},
year = {2017}
}
备注
53 pages, 20 figures, package homepage: http://surveillance.r-forge.r-project.org/