癌变过程中遗传异质性的空间度量
种群与进化
2015-11-03 v1 组织与器官
摘要
本工作中，我们探索从健康组织开始的肿瘤发生过程中空间异质性的时间动态。我们利用结构组织中突变积累与克隆扩张的空间随机过程模型来描述此过程。在两步肿瘤发生模型下，我们首先推导了一个非空间多样性度量——辛普森指数（Simpson's Index，即从种群中随机抽样的两个个体相同的概率）——在癌前种群中的估计。接下来我们分析两个新的空间种群异质性度量。特别地，我们研究癌变过程中遗传异质性的典型长度尺度，并给定癌前点活检的临床观察估计周围癌前克隆的范围。该进化框架为日益增多的致力于更好理解癌症起始与进展的空间种群动力学的文献做出贡献。尽管最初受癌症中理解问题的启发，这些结果可更普遍地应用于帮助理解多种空间结构演化种群中异质性与多样性的动态。
引用
@article{arxiv.1511.00062,
title = {Spatial measures of genetic heterogeneity during carcinogenesis},
author = {K. Storey and M. D. Ryser and K. Leder and J. Foo},
journal= {arXiv preprint arXiv:1511.00062},
year = {2015}
}