基因调控模型网络中的稀疏关键相互作用
分子网络
2009-10-22 v1 统计力学
摘要
基因调控网络通常具有低入度,即任意给定基因仅受网络中少数基因的调控。哪些机制可能导致这些低入度?从转录因子与DNA结合的公认框架出发,我们考虑一个简单的基因调控动力学模型。在该模型中,我们证明,给定功能约束会导致与功能兼容的最小连接性的出现。我们在模型的一个极限情形下数学地展示了这一行为,并证明它在完整模型中也会出现。因此,这些基因网络中的功能是简约的,即集中在稀疏数量的相互作用上(例如通过其关键性来衡量)。因此,我们的模型为稀疏调控网络的出现提供了一种简单机制,并导致突变的效应非常异质。
引用
@article{arxiv.0910.4077,
title = {Sparse essential interactions in model networks of gene regulation},
author = {Z. Burda and A. Krzywicki and O. C. Martin and M. Zagorski},
journal= {arXiv preprint arXiv:0910.4077},
year = {2009}
}
备注
9 pages, 5 figures