基因调控网络布尔模型的鲁棒性与脆弱性
分子网络
2007-05-23 v1
摘要
基因与基因产物之间的相互作用形成复杂回路,使细胞能够处理信息并响应外部信号。理论研究常以连续、随机或逻辑方法描述这些相互作用。我们提出一种新的基因调控网络建模框架,它结合了基因状态定性描述的直观吸引力与在细胞过程持续时间中纳入随机性的高度灵活性。我们将方法应用于体节极性基因的调控网络,从而对新表达模式的发展获得新颖见解。例如,我们显示极短的合成与衰减时间会扰动野生型模式。另一方面,翻译前与翻译后过程间的时间尺度分离以及最小预模式确保了无论波动如何都收敛于野生型表达模式。
引用
@article{arxiv.q-bio/0501037,
title = {Robustness and fragility of Boolean models for genetic regulatory networks},
author = {Madalena Chaves and Reka Albert and Eduardo D. Sontag},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0501037},
year = {2007}
}
备注
29 pages, 5 figures, accepted to the Journal of Theoretical Biology