SIM-CE：用于研究秀丽隐杆线虫大脑的高级Simulink平台
神经元与认知
2017-03-28 v3 神经与进化计算
定量方法
机器学习
摘要
我们介绍SIM-CE，一个在Simulink中构建的先进、用户友好的建模与仿真环境，用于对秀丽隐杆线虫（C. elegans）神经系统进行多尺度行为分析。SIM-CE包含秀丽隐杆线虫神经元与突触数学模型的Simulink实现，用户可轻松扩展和具体化。该Simulink模型能够捕捉离子通道的复杂动力学以及额外的生物物理细节，如细胞内钙离子浓度。我们通过执行神经元、突触和神经回路层面的行为仿真来展示SIM-CE的性能。此类环境使用户能够捕捉神经回路的未知特性、检验假说并确定该蠕虫所展现的多种行为可塑性的根源。
引用
@article{arxiv.1703.06270,
title = {SIM-CE: An Advanced Simulink Platform for Studying the Brain of Caenorhabditis elegans},
author = {Ramin M. Hasani and Victoria Beneder and Magdalena Fuchs and David Lung and Radu Grosu},
journal= {arXiv preprint arXiv:1703.06270},
year = {2017}
}