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DNA变性无序广义Poland--Scheraga模型的尺度极限

概率论 2024-06-18 v2 数学物理 math.MP

摘要

Poland--Scheraga模型于1970年代提出,是描述DNA变性转变的参考模型。近年来,该模型被推广以允许链长不对称及环的形成:其数学表示基于一个双变量更新过程,描述成对结合的基础碱基。在本文中,我们考虑该模型的一个无序版本,其中当第一条链的第ii个单体与第二条链的第jj个单体相遇时,两链通过势βV(ω^i,ωˉj)+h\beta V(\hat\omega_i,\bar\omega_j)+h相互作用。这里,hRh\in\mathbb R是均匀钉扎参数,(ω^i)i1(\hat\omega_i)_{i\geq 1}(ωˉj)j1(\bar\omega_j)_{j\geq 1}是附着于各DNA链的两列独立同分布随机变量,V(,)V(\cdot,\cdot)是相互作用函数,β>0\beta>0为无序强度。我们的主要结果给出了底层双变量更新过程的某些条件,使得若令β,h0\beta,h\downarrow0在链长趋于无穷时以适当(显式)的速率进行,则模型的配分函数承认一个非平凡的、即无序的尺度极限。这被称为中等无序 regime,并与变性转变中无序相关性的问题相联系。有趣且令人惊讶的是,令β0\beta\downarrow0所需的速率依赖于相互作用函数V(,)V(\cdot,\cdot)以及(ω^i)i1(\hat\omega_i)_{i\geq 1}(ωˉj)j1(\bar\omega_j)_{j\geq 1}的分布。另一方面,配分函数的中等无序极限(若存在)是普适的:它表示为对高斯过程M\mathcal{M}的迭代积分的混沌展开,该过程作为场(eβV(ω^i,ωˉj))i,j0(e^{\beta V(\hat\omega_i,\bar\omega_j)})_{i,j\geq 0}的尺度极限出现,并在行与列上表现出强相关性。

关键词

引用

@article{arxiv.2209.13480,
  title  = {Scaling limit of the disordered generalized Poland--Scheraga model for DNA denaturation},
  author = {Quentin Berger and Alexandre Legrand},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2209.13480},
  year   = {2024}
}

备注

60 pages, 7 figures