利用人类从头点突变数据重访中性动力学导出的限制性鸟嘌呤-胞嘧啶含量
基因组学
2022-03-15 v1 种群与进化
摘要
我们重访人类基因组在中性演化下的鸟嘌呤-胞嘧啶（GC）含量问题。本研究中，使用人类内部从头突变数据来估计突变率，而非使用近缘物种间的碱基替换数据。我们随后定义了一种新的突变偏倚测度，将从头突变计数与背景 GC 含量本身分离，使不同数据集间的比较更为容易。我们通过将涉及 CpG 的突变事件作为独立变量分离，推导出计算限制性 GC 含量的新公式。在考虑涉及 CpG 的突变时使用该公式，GC 含量在中性动力学极限下下降较缓。在某些假设下，我们提供证据表明，类似同源异构区（isochore）的结构可能作为中性突变动力学的限制性构型保留下来。
引用
@article{arxiv.2008.01781,
title = {Revisiting the Neutral Dynamics Derived Limiting Guanine-Cytosine Content Using the Human De Novo Point Mutation Data},
author = {Wentian Li and Yannis Almirantis and Astero Provata},
journal= {arXiv preprint arXiv:2008.01781},
year = {2022}
}
备注
4 figures