从临界力分布可靠提取能量景观性质
生物物理
2020-07-01 v2 软凝聚态物质
摘要
生物聚合物的结构动力学由其通过构象能量景观的扩散过程所支配。在利用光镊的拉伸实验中,能量景观的特征可从聚合物解折叠时临界力概率分布中提取。分析通常基于具有 Bell-Evans 形式的速率方程,尽管人们明白该建模是不充分的,并在许多常见情形下导致不可靠的景观参数。Dudko 及其合作者 [Phys. Rev. Lett. 96, 108101 (2006)] 强调了这一批评,并提出了一种包含额外形状参数(并作为特例退化为 Bell-Evans)的替代形式。然而,他们的拟合函数在拉伸力分布的尾端是病态的,这带来了其自身的问题。我们提出了一种修正的临界力分布闭式表达式,其正确纳入了拉伸力的下一阶修正且在各处行为良好。我们主张这一新表达式提供了更优的参数提取,并即便在中等拉伸速率下也有效。我们给出了基于模拟数据的结果,证实了其效用。
引用
@article{arxiv.2001.02702,
title = {Reliable extraction of energy landscape properties from critical force distributions},
author = {Sudeep Adhikari and K. S. D. Beach},
journal= {arXiv preprint arXiv:2001.02702},
year = {2020}
}
备注
8 pages, 7 figures; v2 includes minor edits to match the published version