压缩力与拉伸力决定了单分子拉伸实验中折叠景观参数的准确性
软凝聚态物质
2015-05-27 v1 生物物理
生物大分子
摘要
我们建立了一个框架，用于评估从单分子拉伸实验推断出的生物聚合物过渡态位置，是否对应于具有相同概率到达折叠或去折叠状态（Pfold = 0.5）的结构系综。利用 RNA 发夹的力致去折叠结果、一个精确可解模型和解析理论，我们证明了 Pfold 仅由 s 决定，s 是一个实验可测量的分子张拉整体参数，它是拉伸力与稳定折叠态的压缩力之比。对具有双势垒的 DNA 发夹和亮氨酸拉链折叠景观的应用，为单分子实验数据提供了结构解释。我们的理论可用于评估利用测得的自由能谱判断分子延伸是否为一个好的反应坐标。
引用
@article{arxiv.1103.0425,
title = {Compaction and tensile forces determine the accuracy of folding landscape parameters from single molecule pulling experiments},
author = {Greg Morrison and Changbong Hyeon and Michael Hinczewski and D. Thirumalai},
journal= {arXiv preprint arXiv:1103.0425},
year = {2015}
}
备注
6 pages, 4 figures, Phys. Rev. Lett. (in press)