利用结构相互作用组学进行遗传疾病遗传方式和分子机制的蛋白质组范围预测
定量方法
2025-06-17 v2 基因组学
摘要
遗传疾病可根据其遗传方式和潜在分子机制进行分类。常染色体显性遗传病通常由导致功能丧失、功能获得或显性负效应的DNA变异引起,而常染色体隐性遗传病主要与功能丧失变异相关。在本研究中,我们引入了一种图之图方法,该方法利用蛋白质-蛋白质相互作用网络和高分辨率蛋白质结构来预测由常染色体基因变异引起的疾病的遗传方式,并根据功能效应对显性相关蛋白进行分类。我们的方法整合了图神经网络、结构相互作用组学和拓扑网络特征,以提供蛋白质组范围的预测,从而为理解遗传疾病机制提供了一种可扩展的方法。
引用
@article{arxiv.2410.17708,
title = {Proteome-wide prediction of mode of inheritance and molecular mechanism underlying genetic diseases using structural interactomics},
author = {Ali Saadat and Jacques Fellay},
journal= {arXiv preprint arXiv:2410.17708},
year = {2025}
}