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主成分追踪用于环境混合物中的模式识别

应用统计 2021-11-02 v1 信号处理 统计方法学 其他统计学

摘要

环境健康研究者通常旨在识别导致潜在有害暴露的源/行为。我们改编了主成分追踪(PCP)——一种用于计算机视觉与信号处理中鲁棒降维的技术——以识别环境混合物中的模式。PCP 将暴露混合物分解为包含跨污染物一致暴露模式的低秩矩阵,以及隔离独特暴露事件的稀疏矩阵。我们调整 PCP 以适应非负与缺失数据,以及低于给定检测限(LOD)的值。我们模拟了两种规模、具有递增比例 <LOD 和三种噪声结构的数据以代表环境混合物。我们将 PCP-LOD 与主成分分析(PCA)比较以评估性能。接下来我们将 PCP-LOD 应用于 2001-2002 年国家健康与营养检查调查中测量的 1,000 名美国成年人的 21 种持久性有机污染物(POPs)混合物。我们对估计的低秩矩阵应用奇异值分解以刻画模式。PCP-LOD 通过交叉验证在所有模拟中恢复了真实的模式数;基于先验指定准则,PCA 在 32% 的模拟中恢复了真实模式数。对于最多 50% 数据 <LOD 的所有模拟数据集,PCP-LOD 相较 PCA 取得了更低的相对预测误差。当 75% 的值 <LOD 时,仅当噪声较低时 PCP-LOD 优于 PCA。在 POP 混合物中,PCP-LOD 识别出秩三的底层结构并将 6% 的值分离为独特事件。一种模式代表对所有 POPs 的全面暴露。其他模式基于已知结构与毒性对化学品分组。PCP-LOD 作为一种有用工具,将多维暴露表达为一致模式,若发现其与不良健康相关,则便于针对性干预。

关键词

引用

@article{arxiv.2111.00104,
  title  = {Principal Component Pursuit for Pattern Identification in Environmental Mixtures},
  author = {Elizabeth A. Gibson and Junhui Zhang and Jingkai Yan and Lawrence Chillrud and Jaime Benavides and Yanelli Nunez and Julie B. Herbstman and Jeff Goldsmith and John Wright and Marianthi-Anna Kioumourtzoglou},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2111.00104},
  year   = {2021}
}

备注

32 pages, 11 figures, 4 tables