网络描述在理解ABC转运蛋白构象变化和质子化状态中的潜在应用
分子网络
2013-09-18 v2
摘要
ABC（ATP结合盒）转运蛋白超家族包含大量普遍存在且功能多样的蛋白质，从古菌到人类都保守。ABC转运蛋白在许多人类疾病以及癌症和寄生虫的多药耐药性发展中起关键作用。尽管在过去几十年中ABC蛋白研究取得了显著进展，但我们仍远未详细了解其分子功能。药理学ABC转运蛋白靶向的几个方面也仍不清楚。本文总结了ABC转运蛋白的构象和质子化变化，以及这些信息在药理学设计中的潜在用途。网络相关方法最近成为描述蛋白质结构和动力学的有用工具，但尚未应用于研究ABC蛋白中的变构耦合。本文详细描述了这些方法的优势和局限性，并概述了它们在描述ABC转运蛋白动力学中的潜在用途。最后，我们强调了网络方法在药理学利用方面的可能未来方向，并概述了这一令人兴奋领域的未来趋势。
引用
@article{arxiv.1206.0123,
title = {Potential application of network descriptions for understanding conformational changes and protonation states of ABC transporters},
author = {Tamas Hegedus and Gergely Gyimesi and Merse E. Gaspar and Kristof Z. Szalay and Rajeev Gangal and Peter Csermely},
journal= {arXiv preprint arXiv:1206.0123},
year = {2013}
}
备注
18 pages, 3 Figures and 241 references